Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Alkbh8Q80Y20 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms