Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2eQ80UW8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms