Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2q1Q7TSS2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms