Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actn1Q7TPR4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Actn1Q7TPR4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms