Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrc2bQ7TPM1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrc2bQ7TPM1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrc2bQ7TPM1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrc2bQ7TPM1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prrc2bQ7TPM1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prrc2bQ7TPM1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms