Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mfsd13aQ6PDE8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mfsd13aQ6PDE8 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms