Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt39Q6IFX4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt39Q6IFX4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms