Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms