Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top2bQ64511 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2bQ64511 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms