Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
PtprdQ64487 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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PtprdQ64487 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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PtprdQ64487 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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PtprdQ64487 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
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PtprdQ64487 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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PtprdQ64487 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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