Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Ss18Q62280 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ss18Q62280 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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