Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Sall3Q62255 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Sall3Q62255 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms