Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sin3bQ62141 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sin3bQ62141 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms