Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Odf1Q61999 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Odf1Q61999 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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