Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lama3Q61789 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Lama3Q61789 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lama3Q61789 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lama3Q61789 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Lama3Q61789 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lama3Q61789 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Lama3Q61789 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lama3Q61789 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms