Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Msi1Q61474 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Msi1Q61474 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms