Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PcolceQ61398 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PcolceQ61398 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PcolceQ61398 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PcolceQ61398 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PcolceQ61398 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PcolceQ61398 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PcolceQ61398 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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PcolceQ61398 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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PcolceQ61398 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
PcolceQ61398 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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