Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usf1Q61069 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Usf1Q61069 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Usf1Q61069 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usf1Q61069 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Usf1Q61069 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Usf1Q61069 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms