Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q5XFZ0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms