Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znrf3Q5SSZ7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znrf3Q5SSZ7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znrf3Q5SSZ7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znrf3Q5SSZ7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Znrf3Q5SSZ7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znrf3Q5SSZ7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znrf3Q5SSZ7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Znrf3Q5SSZ7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Znrf3Q5SSZ7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Znrf3Q5SSZ7 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znrf3Q5SSZ7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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