Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Trim58Q5NCC9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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Trim58Q5NCC9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Trim58Q5NCC9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Trim58Q5NCC9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Trim58Q5NCC9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim58Q5NCC9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Trim58Q5NCC9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Trim58Q5NCC9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Trim58Q5NCC9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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Trim58Q5NCC9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim58Q5NCC9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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