Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rtl5Q5DTT4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rtl5Q5DTT4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms