Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pydc3Q3V3Q4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pydc3Q3V3Q4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms