Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ckap2Q3V1H1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ckap2Q3V1H1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms