Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk4Q3V129 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms