Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lrrc43Q3V0L5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc43Q3V0L5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms