Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc27Q3V036 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc27Q3V036 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms