Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 9330104G04Rik-201ENSMUST00000181501 2242 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Olfr429-202ENSMUST00000216346 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Lmx1a-202ENSMUST00000111377 3200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
SvipQ3UZP4 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC9.09□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SvipQ3UZP4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms