Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms