Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Cops9Q3U898 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms