Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Rnf180Q3U827 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms