Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 9930120I10Rik-201ENSMUST00000203027 865 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gtpbp6Q3U6U5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms