Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl1Q2VPR5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdgfl1Q2VPR5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms