Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Samd11Q1RNF8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Samd11Q1RNF8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms