Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd2Q149F1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd2Q149F1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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