Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NeblQ0II04 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NeblQ0II04 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms