Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou6f1Q07916 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pou6f1Q07916 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms