Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cntn3Q07409 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cntn3Q07409 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms