Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gdf3Q07104 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gdf3Q07104 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms