Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Siah2Q06986 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Siah2Q06986 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms