Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Sox12Q04890 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Sox12Q04890 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms