Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Top1Q04750 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms