Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smarcad1Q04692 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smarcad1Q04692 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms