Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddr1Q03146 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddr1Q03146 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms