Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gjb4Q02738 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms