Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sec23aQ01405 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms