Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SelpQ01102 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SelpQ01102 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SelpQ01102 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms