Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Serpina1cQ00896 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms