Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms