Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pax8Q00288 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Pax8Q00288 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms